Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSPO3Q9BXY4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSPO3Q9BXY4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSPO3Q9BXY4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSPO3Q9BXY4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSPO3Q9BXY4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSPO3Q9BXY4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSPO3Q9BXY4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSPO3Q9BXY4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RSPO3Q9BXY4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms