Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms