Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms