Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms