Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC106Q9BWC9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms