Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEC22CQ9BRL7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms