Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms