Protein–RNA interactions for Protein: Q99502

EYA1, Eyes absent homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA1Q99502 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EYA1Q99502 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EYA1Q99502 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms