Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms