Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALS2Q96Q42 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALS2Q96Q42 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms