Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
JSRP1Q96MG2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms