Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOLD1Q96LR9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOLD1Q96LR9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms