Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms