Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EP400Q96L91 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms