Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPNS2Q96L46 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms