Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXPE2Q96DL1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXPE2Q96DL1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXPE2Q96DL1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXPE2Q96DL1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXPE2Q96DL1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NXPE2Q96DL1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXPE2Q96DL1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXPE2Q96DL1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXPE2Q96DL1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXPE2Q96DL1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NXPE2Q96DL1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXPE2Q96DL1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXPE2Q96DL1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXPE2Q96DL1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXPE2Q96DL1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXPE2Q96DL1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXPE2Q96DL1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXPE2Q96DL1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXPE2Q96DL1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXPE2Q96DL1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NXPE2Q96DL1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NXPE2Q96DL1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NXPE2Q96DL1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NXPE2Q96DL1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms