Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAF2Q96CS3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms