Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG2BQ96BY7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms