Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SMARCE1Q969G3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMARCE1Q969G3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms