Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR2Q969E8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms