Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF4BQ92750 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF4BQ92750 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms