Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms