Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD1Q8NHV4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms