Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNBD1Q8NA66 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms