Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ANKRD53Q8N9V6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms