Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM71E2Q8N5Q1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms