Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms