Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP50Q70EL3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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