Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM179Q6ZVK1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM179Q6ZVK1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms