Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRIG3Q6UXM1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms