Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VITQ6UXI7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VITQ6UXI7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms