Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms