Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms