Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NANOGP8Q6NSW7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms