Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL2Q6F5E8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms