Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATL3Q6DD88 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms