Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf84Q5VXU9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf84Q5VXU9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms