Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AC003075.1-208ENST00000415246 596 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CHIC1Q5VXU3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 C9orf85-203ENST00000377031 1107 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 BCAS2P3-201ENST00000416374 767 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 AC084759.2-202ENST00000557976 1053 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 AL136981.1-204ENST00000425090 461 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 AP005597.1-201ENST00000534192 802 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 CCL11-201ENST00000305869 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CHIC1Q5VXU3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms