Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYOM3Q5VTT5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms