Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LGSNQ5TDP6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms