Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC39AQ5SRH9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC39AQ5SRH9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms