Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SDK2Q58EX2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms