Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ANKRD39Q53RE8 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms