Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NBPF1Q3BBV0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms