Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A8Q2Y0W8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms