Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISXQ2M1V0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms