Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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GEN1Q17RS7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
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