Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DDB1Q16531 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
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