Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC1Q15915 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIC1Q15915 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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