Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SF1Q15637 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SF1Q15637 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SF1Q15637 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SF1Q15637 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SF1Q15637 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SF1Q15637 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SF1Q15637 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SF1Q15637 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SF1Q15637 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SF1Q15637 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SF1Q15637 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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